El Departamento de Territorio se ocupa de ordenar el desarrollo territorial de Mallorca y de controlar la legalidad del planeamiento urbanístico.
Igualmente ejerce el control de usos al suelo rústico y de una parte del litoral, y se encarga de hacer cumplir la legalidad urbanística vigente. Asesora los ayuntamientos en la adaptación de los planes municipales a los planes directores sectoriales insulares y expide las cédulas de habitabilidad de edificios y viviendas.
Desarrolla las políticas de paisaje de Mallorca, así como otras figuras de ordenación territorial de las políticas sectoriales, como por ejemplo la intervención en ámbitos turísticos y la distribución adecuada de los establecimientos comerciales.
Coordina el desarrollo del programa «Serra de Tramontana patrimonio mundial».